在新时代背景下，深化党和国家机构改革是一项系统性工程，需要以科学的原则为指导，确保改革顺利推进并取得实效。这一过程不仅关乎国家治理体系和治理能力现代化的实现，更直接影响到社会经济发展的稳定性和持续性。

首先，坚持党的全面领导是根本保证。党的领导是中国特色社会主义最本质的特征，也是中国特色社会主义制度的最大优势。因此，在整个改革过程中，必须始终把加强党的全面领导贯穿始终，确保改革方向正确无误，各项政策措施能够得到有效落实。

其次，以人民为中心的发展思想不可动摇。人民是历史的创造者，也是推动社会进步的根本力量。任何一项改革措施都应当从人民群众的根本利益出发，充分考虑广大民众的实际需求，使改革成果更多更好地惠及全体人民。

再次，统筹协调与分类指导相结合至关重要。由于不同地区、部门之间存在差异性，在推进改革时应采取因地制宜的方法，既要注重整体规划，又要灵活应对具体问题，做到既统一又富有弹性，从而提高改革的整体效能。

此外，依法依规进行改革同样必不可少。法治是现代社会治理的基本方式之一，任何改革行动都必须严格遵守法律法规，确保程序正当合法，避免出现随意性和盲目性。

最后，强化监督评估机制有助于保障改革成效。建立健全有效的监督体系，对改革进展情况进行动态跟踪分析，并及时总结经验教训，不断优化调整策略，促使改革朝着预期目标稳步迈进。

综上所述，深化党和国家机构改革是一项复杂而艰巨的任务，只有始终坚持上述基本原则，才能确保改革顺利实施，最终达成预期目的，为实现中华民族伟大复兴提供坚实的制度支撑。