故事开始于家族创始人乌尔苏拉和何塞·阿卡迪奥·布恩迪亚夫妇离开故乡，寻找新的生活之地。他们在一片荒凉的土地上建立了马孔多，并逐渐发展成一个繁荣的小城。然而，这个家族的命运却始终笼罩在孤独之中。每一代人都试图摆脱孤独，但最终都未能如愿。
第一代的乌尔苏拉一直努力维持家庭的团结，而她的丈夫则沉迷于科学研究和神秘学；第二代的奥雷连诺上校领导了多次战争，但内心深处却深陷孤独；第三代的阿玛兰妲则因嫉妒和悔恨终其一生未嫁。到了第四代，家族的成员们开始出现精神上的崩溃，他们的命运如同被诅咒一般，不断重复着祖先的故事。
随着岁月流逝，布恩迪亚家族逐渐走向衰败，马孔多也因外来的势力入侵而变得混乱不堪。最终，在一场突如其来的飓风中，整个小镇连同布恩迪亚家族一起消失在历史长河中。
《百年孤独》通过这样一个家族的故事，不仅反映了拉丁美洲社会变迁的过程，还探讨了人性、爱情、权力以及时间等永恒主题。它以其独特的叙事风格和深刻的思想内涵成为世界文学宝库中的瑰宝。
